ボスニアは混合民族であり、独自の国家的象徴を発達させたことはありません。たとえば、1946年から1991–92年までの共産主義主導のユーゴスラビアの下では、ボスニア社会主義共和国とヘルツェゴビナは、カントンに小さなバージョンのユーゴスラビア国旗の赤い旗を使用しました。独立が1992年3月3日に宣言された当時、国のボスニア人、セルビア人、およびクロアチア人が受け入れることのできる旗は存在しませんでした。したがって、ボスニア支配の政府は、それが望んでいたことを、はるか昔からの中立的な象徴とすることを採用した。StjepanTomaš王（1443–61年）が使用した紋章を選択しました。これは、中世の偉大なボスニアの統治者であるTvrtko I（1377–91）に帰属します。6つの金色のアヤメを分離する白い斜めの縞模様のその青い盾は、白い旗の中央に置かれました。1992年5月4日に正式に採用された芸術的表現は、ズヴォニミールベベックによって作成されました。
国が内戦に陥ったため、この旗は多くのクロアチア人とセルビア人によって拒否されました。米国オハイオ州デイトンで1995年後半に締結された和平協定により、セルビア共和国とボスニアヘルツェゴビナ連邦との間の同国の分割は、しばしばクロアチアムスリム連合と呼ばれました。各州には独自のシンボルがあり、クロアチア人は連邦旗よりもクロアチアの旗を使い続けましたが、1992年の共和国の旗は依然として国際的に認められていました。
1995年の合意では、最終的には1992年のデザインに代わる旗を作成するよう求めたが、国の議会はこの点で効果がなかった。したがって、国連は、単一の民族、宗教、または政治グループに象徴的に関連付けることができなかった新しい旗（1998年2月4日）を確立しました。
